RAS PhysicsПисьма в Журнал экспериментальной и теоретической физики JETP Letters (Journal of Experimental and Theoretical Physics Letters)

  • ISSN (Print) 0370-274X
  • ISSN (Online) 3034-5766

Микроскопический механизм денатурации белков и нуклеиновых кислот бактерий Р. aeruginosa при резонансном поглощении фемтосекундных лазерных импульсов с длиной волны 6 мкм

PII
S30345766S0370274X25080114-1
DOI
10.7868/S3034576625080114
Publication type
Article
Status
Published
Authors
Volume/ Edition
Volume 122 / Issue number 3-4
Pages
184-190
Abstract
Образцы плактона бактерий Р. aeruginosa на ИК-прозрачной кремниевой подложке впервые исследованы методом спектроскопии динамического пропускания в отношении фемтосекундных лазерных импульсов с длиной волны 6 мкм и варьируемой пиковой интенсивностью в диапазоне 3–5·10 ГВт/см – с превышением порога ≈ 3 · 10 ГВт/см для неразрушающей инактивации данных бактерий. С ростом интенсивности лазерного излучения поочередно наблюдаются выгорание полосы резонансного гармонического поглощения C=O-связи амидной группы белков и нуклеиновых кислот бактерий (волновое число – 1650 см), "синий" сдвиг полосы на ≈ 200 см, и последующий "красный" ангармонический сдвиг этой полосы на величину до 350-400 см. Квантово-механический анализ колебаний близких по структуре молекул в рамках колебательной теории возмущений 2-го порядка показал, что положение полосы C=O-связи при "синем" сдвиге отвечает колебаниям в отсутствие водородных связей, а ее значительный "красный" сдвиг вызван ангармонизмом, который для первого колебательного кванта достигает 30 см. На основании этих данных предложен молекулярный механизм сверхбыстрого разрушения вторичной структуры белков и нуклеиновых кислот бактерий Р. aeruginosa под действием фемтосекундных лазерных импульсов с длиной волны 6 мкм через мгновенный разрыв водородной связи на C=O моде при поглощении первого ИК-фотопа и перманентную фиксацию разрыва через высокоуровневое колебательное возбуждение при пороговой интенсивности излучения.
Keywords
Date of publication
03.07.2025
Year of publication
2025
Number of purchasers
0
Views
37

References

  1. 1. T. Toyama, J. Fujioka, K. Watanabe, A. Yoshida, T. Sakuma, K. Inaba, T. Imai, T. Nakajima, K. Tsukiyama, N. Hamada, and F. Yoshino, Sci. Rep. 12(1), 18111 (2022).
  2. 2. V. Kompanets, S. Shelygina, E. Tolordava, S. Kudryashov, I. Saraeva, A. Rupasov, O. Baitsaeva, R. Khmelnitskii, A. Ionin, Yu. Yushina, S. Chekalin, and M. Kovalev, Biomed. Opt. Express 12(10), 6317 (2021).
  3. 3. С.Н. Шелыгина, И.Н. Сараева, Э.Р. Толордава, А.А. Настулявичус, and С.И. Кудряшов, Краткие сообщения по физике Физического института им. П. Н. Лебедева Российской Академии Наук 50(10), 29 (2023).
  4. 4. A. A.Oduola, R. Bowie, S. A. Wilson, Z. MohammadiShad, and G. G. Atungulu, Journal of Food Safety 40(2), e12764 (2020).
  5. 5. J. P. Maity, S. Kar, C. M. Lin, C. Y. Chen, Y. F. Chang, J. S. Jean, and T. R. Kulp, Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy 116, 478 (2013).
  6. 6. R. R. Breaker and G. F. Joyce, Chemistry & Biology 21(9), 1059 (2014).
  7. 7. N. F. Goodacre, D. L. Gerloff, and P. Uetz, MBio 5(1), 10 (2014).
  8. 8. C. Kolano, J. Helbing, M. Kozinski, W. Sander, and P. Hamm, Nature 444(7118), 469 (2006).
  9. 9. R. Laenen, C. Rauscher, and A. Laubereau, The Journal of Physical Chemistry A 101(18), 3201 (1997).
  10. 10. В.О.Компанец, С.И. Кудряшов, Э. Р. Толордава, С.Н. Шелыгина, В.В. Соколова, И.Н. Сараева, М.С. Ковалев, А.А. Ионин, С. В. Чекалин, Письма в ЖЭТФ 113(6), 365 (2021).
  11. 11. S. Shelygina, V. Kompanets, E. Tolordava, S. Gonchukov, S. Chekalin, and S. Kudryashov, Laser Phys. Lett. 19(1), 015602 (2021).
  12. 12. K. Tian, M. Xiang, X. Wen et al. (Collaboration), Laser & Photonics Rev. 18(2), 2300421 (2024).
  13. 13. J. Guo, P. Chen, M. Xiang, K. Tian, Z. Wan, L. He, W. Li, X. Peng, Yu. Peng, X. Wen, L. Liu, Q. J. Wang, Y. Leng, and H. Liang, Communications Medicine 5(1), 1 (2025).
  14. 14. V. Barone, J. Bloino, and M. Biczysko, Vibrationally-resolved electronic spectra in GAUSSIAN 09. Revision a 2(1) (2009).
  15. 15. P. J.Singh, A. K. Das, K. K. Gorai, A. Shastri, D. V. Udupa, and B. N. Rajasekhar, Journal of Quantitative Spectroscopy and Radiative Transfer 280, 108092 (2022).
  16. 16. A. Barth, Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Bioenergetics 1767(9), 1073 (2007).
  17. 17. В.С. Летохов, В.П. Чеботаев, Успехи физических наук 113(7), 385 (1974).
  18. 18. Л. Беллами, Новые данные по ИК-спектрам сложных молекул, Мир, М. (1971).
  19. 19. M. L. Cowan, B. D. Bruner, N. Huse, J. R. Dwyer, B. Chugh, E. T. J. Nibbering, T. Elsaesser, R. J. D. Miller, Nature 434(7030), 199 (2005).
  20. 20. И. П. Макарова, Физика твердого тела 57(3), 432 (2015).
  21. 21. А. А. Мельникова, Р. А. Камышинский, А. В. Комова, А. П. Руденко, З. В. Намсараев, Известия Российской академии наук. Серия физическая 85(8), 1070 (2021).
  22. 22. Н. П. Ковалец, И. В. Разумовская, С. А. Бедин, А. В. Наумов, Письма в ЖЭТФ 118(4), 245 (2023).
  23. 23. И. Ю. Еремчев, Д. В. Прокопова, Н. Н. Лосевский, И. Т. Мынжасаров, С. П. Котова, А. В. Наумов, Успехи физических наук 192(6), 663 (2022).
  24. 24. М. Ю. Еремчев, А. В. Наумов, Письма в ЖЭТФ 121(3), 240 (2025).
QR
Translate

Индексирование

Scopus

Scopus

Scopus

Crossref

Scopus

Higher Attestation Commission

At the Ministry of Education and Science of the Russian Federation

Scopus

Scientific Electronic Library